クリアするまで脱出不可能、ゲームオーバーは本当の“死”を意味する──。謎の次世代MMO『ソードアート・オンライン』の“真実”を知らずログインした約一万人のユーザーと共に、その過酷なデスバトルは幕を開けた。　SAOに参加した一人である主人公・キリトは、いち早くこのMMOの“真実”を受け入れる。そして、ゲームの舞台となる巨大浮遊城『アインクラッド』で、ソロプレイヤーとして頭角をあらわしていった。　クリア条件である最上階層到達を目指し、熾烈なクエストを単独で続けるキリトだったが、レイピアの名手・女流剣士アスナの強引な誘いによって彼女とコンビを組むことになってしまう。その出会いは、キリトに運命とも呼べる契機をもたらし……。

自分の部屋に、純白のシスターがいきなり空から降ってきた。「ありえねぇ……」上条当麻はつぶやくが、そのシスター姿の少女はこう言った。自分は魔術の世界から逃げたきた――と。ここは”超能力者”が”一般科学”として認知された、アンチ・オカルトの学園都市。上条は『インデックス』と名乗る謎の少女の言動をいぶかしむが、二人の前に本当に”魔術師”が現れて――！

行商人のロレンスは、馬車の荷台で麦の束に埋もれて眠る少女を見つける。　少女は狼の耳と尾を持つ美しい娘で、自らを豊作を司る神・ホロと名乗った。
　「わっちは神と呼ばれたがよ。わっちゃあ、ホロ以外の何者でもない」　
まるで経験を積んだ大人のような話し方で、ロレンスを巧みに翻弄する少女。最初は半信半疑だったロレンスも、やがてホロが旅に同行することを承諾する。
そんなふたりの旅に、思いがけない儲け話が舞い込んでくる。　近い将来、ある銀貨が値上がりするという噂。　疑いながらも、ロレンスはその儲け話に乗るのだが……。